Stikstoffixatie in suikerriet en Pseudomonas stutzeri met gastrijst

Zeventien bacteriestammen werden geïsoleerd uit rhizosfeergrond en oppervlakte-gesteriliseerde wortels van suikerriet en bleken 12 soorten te vertegenwoordigen die verdeeld waren over de 6 geslachten Klebsiella, Burkholderia, Erwinia, Enterobacter, Bacillus en Ralstonia op basis van 16S rDNA-sequenties. Een aantal oxidatie van substraatgebruikspatronen werden waargenomen in de Rifr-mutanten van P. stutzeri die het gebruik van carboxylzuren en aminozuren significant verhoogden in verschillende Rifr-mutanten dan die van het wilde type. Om het plant-microbe-interactiemechanisme te onderzoeken werd een set van 20 genen die verantwoordelijk zijn voor de chemotactische motiliteit en de kolonisatie van het worteloppervlak geselecteerd en werd hun expressie bepaald in de aanwezigheid van rijstwortelextracten. Na inductie van 1u bleek dat pilK-, metE- en rpoN-transcriptie respectievelijk 5,7, 6,4 en 3,4-voudig toenamen, terwijl het fdhE-gen geen expressie heeft. Bijgevolg werden de pilK-, fdhE-, metE- en rpoN-genen na inducties van 4u respectievelijk -1,9, -4,4, -0,2 en -0,8-voudig verlaagd. Deze resultaten suggereren dat de plant-microbe interactie wordt gecontroleerd door complexe regulerende systemen.