Gene, Graphen, Organismen

Das vorliegende Buch entstand aus dem Pilotprojekt " Projekt Interdisziplinäres Lernen und Zusammenarbeit" (kurz PILZ), das wir erstmalige im Wintersemester 2007/2008 an der Georg-August-Universität Göttingen durchgeführt haben. In diesem Buch werden die interessanten und teilweise sehr originellen Ideen und Ergebnisse dokumentiert, die im Verlauf des Wintersemesters 2007/2008 durch Studierende der Universität erarbeitet wurden. Darüber hinaus stellt dieses Buch eine kompakte Einführung in ein spannendes Forschungsgebiet der Bioinformatik dar, das im Grenzgebiet zwischen Informatik, Mathematik, Medizin und Biologie angesiedelt ist. Weiter möchte wir mit diesem Buch insbesondere Lehrende ansprechen und animieren, ähnliche Konzepte an ihren Universitäten umzusetzen. Die Idee des PILZ-Projekts ist, Studierenden eine interdisziplinäre und praxisnahe Lehrveranstaltung zu bieten, die ihnen ermöglicht, ihr Wissen auch außerhalb ihres jeweiligen Faches und anhand praktischer Probleme anzuwenden 1 . Im Wintersemester 2007 / 2008 sollte dieses Ziel durch die Bearbeitung von Aufgabenstellungen aus dem Forschungsgebiet Bioinformatik erreicht werden. Dazu wurden in einer Kooperation zwischen dem Lehrstuhl für Diskrete Optimierung (angesiedelt an der Fakultät für Mathematik und Informatik) und der Abteilung für Bioinformatik (Universitätsmedizin) sowie in Zusammenarbeit mit der Firma Biobase 2 vier Aufgabestellungen formuliert und unter dem Namen Gene, Graphen, Organismen - Modellierungs- und Analysemethoden in der Systembiologie zusammengefasst. Um die Studierenden verschiedener Disziplinen auf die Projekte vorzubereiten und den aufgrund der verschiedenen Studienfächer der Teilnehmer teilweise recht unterschiedlichen Kenntnisstand anzugleichen, wurde eine Kompaktwoche angeboten. Innerhalb dieser Kompaktwoche fanden Kurse über mathematische und biologische Grundlagen statt, in denen die Themenbereiche der einzelnen Projekte durch die Projekt-Initiatoren und durch Gäste aus Wissenschaft und Praxis vorgestellt wurden. Im Anschluss an die Kompaktwoche hatten die Projektgruppen sechs Monate Zeit, um die Aufgabenstellungen umzusetzen. Das vorliegende Buch besteht aus zwei Teilen. Der erste Teil enthält Artikel über Grundlagen aus den Bereichen Biologie, Informatik und Mathematik, die zum Verständnis der von den Studierenden bearbeiteten Projekte notwendig sind. Vom Umfang entsprechen die Artikel dem Stoff, der während der Kompaktwoche zu PILZ vorgestellt wurde. Im zweiten Teil des Buchs befinden sich die Projektberichte der Studierenden.