Diseño de un marcador molecular para identificar Chlamydia trachomatis

Chlamydia trachomatis es una bacteria gram negativa intracelular obligada que causa grandes afecciones a la salud de mujeres, hombres y niños y que en la mayoría de los casos no presenta síntomas dificultando su detección. Ante esta problemática se planteó diseñar un marcador molecular eficaz, especifico, sensible y económico para identificar el segmento VS4 del gen omp1 de la proteína MOMP de Chlamydia trachomatis en mujeres embarazadas de un sector de Bogotá e identificar las serovariantes presentes en este segmento que causan infecciones genitales. Para lograrlo se recurrió a programas y herramientas bioinformáticas como GenBank, PickPrimer y Blast de NCBI, NetPrimer y Primer3 para el diseño y comprobación teórica de estos marcadores moleculares; mientras que para la amplificación del segmento se realizaron Reacciones en Cadena de Polimerasa (PCR) convencional, en caliente y en tiempo real para, finalmente, dar lectura en electroforesis con gel de agarosa. Posteriormente, se obtuvo como resultado tres pares de marcadores moleculares llamados SV2, SV4 y SV3 que amplificaron segmentos de 128 pb (región VS3), 277 pb (región VS4) y 282 pb (región VS3-VS4) respectivamente.